バイナリファイルを書き込む場合は、ファイルのオープンモードを「wb」にします。

[c]
#include <stdio.h>

int main(void)
{

short buf[] = {
0x10, 0x20, 0x30
};

FILE *fp;
fp = fopen("d.data", "wb");

fwrite(buf, sizeof(short), 3, fp);

//ファイルを閉じる
fclose(fp);

return 0;
}
[/c]