既に実行しているスレッドを止める場合には以下のよう書きます。

public void stopRunning() {
    running = false;
}

使い方については上記のメソッドを起動するタイミング(操作)を既存のスレッドを利用しているプログラムに適用するように使います。
(実際の例は別途追記)